Kuukautishäiriöt ovat yksi PCOS:n tyypillisimmistä piirteistä. Kuukautiskierrot ovat usein pitkiä ja epäsäännöllisiä, tai kuukautiset puuttuvat kokonaan. Tämä johtuu häiriöstä munasarjojen toiminnassa, jolloin munarakkuloiden kehityskierto jää jumiin, eikä munasolu kypsy valmiiksi asti. Tästä johtuen munasarjojen ulkonäkö ultraäänitutkimuksessa on oireyhtymälle tyypillinen, eli pienet kehittymättömät munarakkulat täyttävät munasarjan. Tällaista munasarjaa kutsutaan monirakkulaiseksi munasarjaksi. Tällöin munasarjan munasolumäärä on suuri, mikä on hieno asia.

Munasarjan korkean munasolumäärän takia munasarjan sisäinen hormonaalinen ympäristö on muuttunut, mikä saattaa estää ovulaation ja vaikeuttaa lapsensaantia. PCOS-naiset saattavatkin joutua turvautumaan hedelmöityshoitoihin muita naisia useammin. Tutkimusten valossa kuitenkin tiedetään, että PCOS-naiset saavat yhtä usein lapsen kuin muutkin naiset.

Myös miessukuhormonien liikatuotanto on tyypillistä naisille, joilla on PCOS. Tämä voi näkyä liiallisena karvankasvuna eli hirsutisminä, miestyypillisenä kaljuuntumisena tai ihomuutoksina, kuten aknena.

Monet aineenvaihdunnan häiriöt ovat yleisiä naisilla, joilla on PCOS. Ylipaino, erityisesti painon kertyminen keskivartalolle, on tyypillistä. Oireyhtymään liittyy myös sokeriaineenvaihdunnan häiriöitä, ja suurempi todennäköisyys sairastua raskaudenaikaiseen ja kakkostyypin diabetekseen. Myös kolesteroliarvot ja verenpaine voivat olla koholla. Tämän lisäksi tutkimukset osoittavat, että PCOS altistaa mielenterveyden ongelmille, kuten ahdistuneisuudelle, masennukselle ja syömishäiriöille.